Sejarah UNJ dimulai dengan kurangnya tenaga kependidikan di semua jenjang dan jenis lembaga pendidikan setelah Indonesia merdeka. Untuk mengatasi masalah ini pemerintah mendirikan berbagai kursus pendidikan guru. Sekira tahun 1950-an, pada jenjang di atas pendidikan menengah didirikan B-I, B-II, dan PGSLP yang bertugas menyiapkan guru-guru untuk sekolah lanjutan. Usaha meningkatkan mutu dan jumlah guru terus dilakukan melalui pendirian Perguruan Tinggi Pendidikan Guru (PTPG) oleh pemerintah melalui Keputusan Menteri P dan K No. 382/Kab. tahun 1954. PTPG ini didirikan di empat kota yakni Batusangkar, Manado, Bandung, dan Malang. Dengan demikian terdapat dua macam lembaga pendidikan yang menghasilkan tenaga guru, yaitu Kursus B-I/B-II/PGSLP dan PTPG. Kedua lembaga ini kemudian diintegrasikan menjadi satu lembaga pendidikan melalui berbagai tahap. Pada 1957, PTPG diintegrasikan ke dalam Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan pada universitas terdekat. Berdasarkan PP No. 51 tahun 1958 Fakultas Paedagogik diintegrasikan ke dalam FKIP. Selanjutnya, berdasarkan Keputusan Menteri P dan K No. 6 dan 7, 8 Februari 1961 Kursus B-I dan B-II diintegrasikan ke dalam FKIP (Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan) di bawah Kementerian Pendidikan Tinggi yang juga menghasilkan guru sekolah menengah. Namun, dualisme ini dirasa kurang efektif dan mengganggu manajemen pendidikan guru. Untuk mengatasi ini maka kursus B-I dan B-II di Jakarta diintegrasikan ke dalam FKIP Universitas Indonesia. Melalui Keputusan Presiden RI No. 1 tahun 1963 tanggal 3 Januari 1963, integrasi sistem kelembagaan pendidikan guru ditetapkan salah satu butir pernyataan Kepres. Surat keputusan ini lalu berlaku sejak 16 Mei 1964, yang kemudian dinyatakan sebagai hari lahirnya IKIP Jakarta. FKIP dan IPG diubah menjadi IKIP (Institut Keguruan dan Ilmu Pendidikan). Dalam perjalanannya kemudian, sejak 4 Agustus 1999 IKIP berubah menjadi Universitas Negeri Jakarta (UNJ) berdasarkan Keppres 093/1999 tanggal 4 Agustus 1999, dan peresmiannya dilaksanakan oleh Presiden Republik Indonesia pada tanggal 31 Agustus 1999 di Istana Negara. Sementara hari jadi Universitas Negeri Jakarta ditetapkan sama dengan hari jadi Institut Keguruan dan Ilmu Pendidikan (IKIP) Jakarta yaitu pada tanggal 16 Mei 1964. Fakultas yang ada di UNJ : 1. Fakultas Ilmu Pendidikan 2. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam 3. Fakultas Teknik 4. Faklultas Ilmu Sosial 5. Fakultas Bahasa dan Seni 6. Fakultas Ilmu Keolahragaan 7. Fakultas Ekonomi 8. Fakultas Program Pascasarjana